Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYH1P12882 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MYH1P12882 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYH1P12882 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYH1P12882 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYH1P12882 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYH1P12882 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYH1P12882 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MYH1P12882 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms