Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL6A2P12110 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms