Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHGAP10645 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHGAP10645 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHGAP10645 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHGAP10645 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHGAP10645 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHGAP10645 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHGAP10645 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHGAP10645 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHGAP10645 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHGAP10645 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHGAP10645 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHGAP10645 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHGAP10645 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHGAP10645 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHGAP10645 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHGAP10645 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHGAP10645 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHGAP10645 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHGAP10645 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHGAP10645 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHGAP10645 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHGAP10645 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHGAP10645 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHGAP10645 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms