Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PKHD1P08F94 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PKHD1P08F94 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms