Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC3A2P08195 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC3A2P08195 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms