Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NGFRP08138 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NGFRP08138 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NGFRP08138 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms