Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOA4P06727 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA4P06727 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms