Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTA1P02549 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms