Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR1AO95602 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms