Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D2O95562 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D2O95562 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms