Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE8BO95263 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE8BO95263 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms