Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC22O60826 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms