Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPLO60437 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPLO60437 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPLO60437 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPLO60437 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPLO60437 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPLO60437 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPLO60437 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPLO60437 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPLO60437 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPLO60437 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPLO60437 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPLO60437 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPLO60437 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPLO60437 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPLO60437 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPLO60437 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPLO60437 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPLO60437 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPLO60437 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPLO60437 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPLO60437 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPLO60437 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPLO60437 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PPLO60437 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PPLO60437 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPLO60437 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPLO60437 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPLO60437 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPLO60437 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPLO60437 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPLO60437 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPLO60437 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPLO60437 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPLO60437 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPLO60437 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPLO60437 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPLO60437 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPLO60437 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPLO60437 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPLO60437 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms