Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX5O60225 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX5O60225 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms