Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSNA1O43805 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms