Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRY3O43610 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRY3O43610 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms