Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1GO43497 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms