Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRPF3O43395 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF3O43395 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRPF3O43395 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms