Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXA3O43365 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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