Protein–RNA interactions for Protein: O15105

SMAD7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD7O15105 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD7O15105 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms