Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L13C9JLJ4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms