Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NOTOA8MTQ0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms