Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD3A6NKT7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD3A6NKT7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms