Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL33A6NCF5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL33A6NCF5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms