Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms