Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KIF3AQ9Y496 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms