Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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HCN4Q9Y3Q4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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HCN4Q9Y3Q4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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HCN4Q9Y3Q4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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HCN4Q9Y3Q4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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HCN4Q9Y3Q4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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HCN4Q9Y3Q4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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HCN4Q9Y3Q4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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HCN4Q9Y3Q4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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HCN4Q9Y3Q4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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HCN4Q9Y3Q4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HCN4Q9Y3Q4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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HCN4Q9Y3Q4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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