Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms