Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRAK1Q9UPV9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAK1Q9UPV9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms