Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
INO80Q9ULG1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
INO80Q9ULG1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms