Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PADI1Q9ULC6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PADI1Q9ULC6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms