Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms