Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FBXL4Q9UKA2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms