Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP21Q9UK80 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP21Q9UK80 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms