Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD1Q9UIS9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms