Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms