Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APEX2Q9UBZ4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APEX2Q9UBZ4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms