Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
CCDC180Q9P1Z9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms