Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCMF1Q9P0J7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms