Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf78Q9NZ63 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf78Q9NZ63 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms