Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM7SF3Q9NS93 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TM7SF3Q9NS93 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms