Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMYD2Q9NRG4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMYD2Q9NRG4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms