Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASS4Q9NQ75 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms