Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3C7

GGNBP2, Gametogenetin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP2Q9H3C7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGNBP2Q9H3C7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms