Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TM6SF1Q9BZW5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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