Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EDEM3Q9BZQ6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms