Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAPERQ9BY12 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAPERQ9BY12 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms