Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SNHG12Q9BXW3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms