Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VN1R3Q9BXE9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VN1R3Q9BXE9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms