Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BBS2Q9BXC9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS2Q9BXC9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms